创新资源与要素相对缺乏。2012年，广州市R&D支出占GDP比例较2011年小幅提升0.02个百分点，达1.94%，远低于北京(5.79%)、上海(3.16%)及周边的深圳(3.81%)，甚至落后于全国平均水平(1.97%)；拥有大专以上学历的人才230万左右，仅为深圳人才总量(350万左右)的64.7%，其中，技能人才160多万人，相当于深圳(220多万)的74.3%；高层次人才方面，广州虽拥有博士后研究人员810多人，但在市属企业博士后科研工作站只有51人，而深圳285名在站博士后研究人员中大部分集中在企业。

　　创新能力与中心城市地位不相吻合。2013年，广州国内发明专利申请量为12156项，远低于北京(67554项)、上海(39157项)和深圳(32200项);国内发明专利授权量为4055项，同样远低于北京(20695项)、上海(10644项)以及深圳(10987项)。

　　自主创新意识不足，科技研发支撑力不够，科研力量与科研成果未能有效实现产业化、市场化转化等，都是导致广州工业创新研发活力不足的原因。未来，自主创新将是广州提升核心竞争力、推动转型升级的关键，广州应从体制机制入手，建立创新的良好环境，构建以企业为主体的自主创新体系。